شهید وارتان آقاخانیان در «سال (۱۳۶۶ هجری شمسی) ۱۹۹۵ میلادی در یک خانواده سنتی و زحمتکش در شهر تهران متولد شد. وارتان فرزند بزرگ آقای گابریل و خانم وارتوش بود» . او یک برادر و دو خواهر نیز داشت. پدرش کشاورز بود و در سال های جوانی خود از روستای سنگباران از توابع فریدن به تهران مهاجرت کرده و پس از مهاجرت در یک کارخانه رنگ سازی مشغول گشت»
. وارتان با گذراندن تحصیلات ابتدایی در مدرسه نائیری تهران تحصیلات خود را در یک هنرستان ادامه داد اما آن را ناتمام گذاشت و به کار پرداخت.
شهید وارتان، در زمستان ۱۹۸۶ میلادی در سن ۱۹ سالگی برای رفتن به خدمت سربازی معرفی شد و به اهواز اعزام شد. او پس از پایان دوره آموزشی به لشکر زرهی ۹۲ اهواز اعزام شد و به جبهه رفت»
این سرباز وطن پرست از ایرانیان مسیحی ارمنی، «در (۱۸ آذر ماه ۱۳۹۶) ۹ دسامبر ۱۹۸۵ میلادی در جزیره مجنون واقع در منطقه جنگی جنوب غرب، به شهادت نایل گشت. مراسم هفتمین روز شهادت وارتان «در ۲۲ دسامبر در کلیسای مترجمان مقدس تهران برگزار شد.
